Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2fQ9CY34 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2fQ9CY34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2fQ9CY34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube2fQ9CY34 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2fQ9CY34 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube2fQ9CY34 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2fQ9CY34 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2fQ9CY34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube2fQ9CY34 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2fQ9CY34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms