Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930535I16RikQ9CUI2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930535I16RikQ9CUI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930535I16RikQ9CUI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms