Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ndufab1Q9CR21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ndufab1Q9CR21 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ndufab1Q9CR21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ndufab1Q9CR21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ndufab1Q9CR21 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ndufab1Q9CR21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ndufab1Q9CR21 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Ndufab1Q9CR21 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ndufab1Q9CR21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ndufab1Q9CR21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ndufab1Q9CR21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ndufab1Q9CR21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ndufab1Q9CR21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufab1Q9CR21 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ndufab1Q9CR21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufab1Q9CR21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ndufab1Q9CR21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ndufab1Q9CR21 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufab1Q9CR21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ndufab1Q9CR21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufab1Q9CR21 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufab1Q9CR21 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufab1Q9CR21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufab1Q9CR21 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufab1Q9CR21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufab1Q9CR21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufab1Q9CR21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufab1Q9CR21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufab1Q9CR21 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufab1Q9CR21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufab1Q9CR21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufab1Q9CR21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms