Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg12Q9CQY1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg12Q9CQY1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg12Q9CQY1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg12Q9CQY1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg12Q9CQY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg12Q9CQY1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg12Q9CQY1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg12Q9CQY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg12Q9CQY1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg12Q9CQY1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg12Q9CQY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg12Q9CQY1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg12Q9CQY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg12Q9CQY1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg12Q9CQY1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg12Q9CQY1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg12Q9CQY1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atg12Q9CQY1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg12Q9CQY1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg12Q9CQY1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms