Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed6Q9CQG0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed6Q9CQG0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed6Q9CQG0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmed6Q9CQG0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed6Q9CQG0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed6Q9CQG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed6Q9CQG0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed6Q9CQG0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed6Q9CQG0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed6Q9CQG0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed6Q9CQG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed6Q9CQG0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms