Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTRAFQ9CQE8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTRAFQ9CQE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RTRAFQ9CQE8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RTRAFQ9CQE8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RTRAFQ9CQE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTRAFQ9CQE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTRAFQ9CQE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTRAFQ9CQE8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTRAFQ9CQE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTRAFQ9CQE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTRAFQ9CQE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTRAFQ9CQE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms