Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab5aQ9CQD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab5aQ9CQD1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab5aQ9CQD1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab5aQ9CQD1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab5aQ9CQD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab5aQ9CQD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab5aQ9CQD1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab5aQ9CQD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab5aQ9CQD1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab5aQ9CQD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab5aQ9CQD1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab5aQ9CQD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab5aQ9CQD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms