Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem216Q9CQC4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem216Q9CQC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem216Q9CQC4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem216Q9CQC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem216Q9CQC4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem216Q9CQC4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem216Q9CQC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem216Q9CQC4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem216Q9CQC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem216Q9CQC4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem216Q9CQC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem216Q9CQC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem216Q9CQC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem216Q9CQC4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem216Q9CQC4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem216Q9CQC4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem216Q9CQC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem216Q9CQC4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem216Q9CQC4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem216Q9CQC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem216Q9CQC4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem216Q9CQC4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms