Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2010109I03RikQ9CQ11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2010109I03RikQ9CQ11 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
2010109I03RikQ9CQ11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2010109I03RikQ9CQ11 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2010109I03RikQ9CQ11 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2010109I03RikQ9CQ11 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010109I03RikQ9CQ11 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2010109I03RikQ9CQ11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
2010109I03RikQ9CQ11 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2010109I03RikQ9CQ11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
2010109I03RikQ9CQ11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2010109I03RikQ9CQ11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2010109I03RikQ9CQ11 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2010109I03RikQ9CQ11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2010109I03RikQ9CQ11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms