Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cadm3Q99N28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cadm3Q99N28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cadm3Q99N28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cadm3Q99N28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cadm3Q99N28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cadm3Q99N28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cadm3Q99N28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cadm3Q99N28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cadm3Q99N28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cadm3Q99N28 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cadm3Q99N28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cadm3Q99N28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cadm3Q99N28 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cadm3Q99N28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cadm3Q99N28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cadm3Q99N28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cadm3Q99N28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms