Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tlcd1Q99JT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tlcd1Q99JT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tlcd1Q99JT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tlcd1Q99JT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tlcd1Q99JT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tlcd1Q99JT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tlcd1Q99JT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tlcd1Q99JT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tlcd1Q99JT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tlcd1Q99JT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tlcd1Q99JT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlcd1Q99JT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlcd1Q99JT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlcd1Q99JT6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlcd1Q99JT6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlcd1Q99JT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlcd1Q99JT6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlcd1Q99JT6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlcd1Q99JT6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlcd1Q99JT6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlcd1Q99JT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tlcd1Q99JT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tlcd1Q99JT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tlcd1Q99JT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tlcd1Q99JT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tlcd1Q99JT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tlcd1Q99JT6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tlcd1Q99JT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tlcd1Q99JT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tlcd1Q99JT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms