Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripply3Q924S9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ripply3Q924S9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply3Q924S9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply3Q924S9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply3Q924S9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripply3Q924S9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripply3Q924S9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripply3Q924S9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripply3Q924S9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripply3Q924S9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms