Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Csmd1Q923L3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Csmd1Q923L3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Csmd1Q923L3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Csmd1Q923L3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
Csmd1Q923L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Csmd1Q923L3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Csmd1Q923L3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Csmd1Q923L3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Csmd1Q923L3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Csmd1Q923L3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,97■■□□□ 1,27
Csmd1Q923L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Csmd1Q923L3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Csmd1Q923L3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Csmd1Q923L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Csmd1Q923L3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Csmd1Q923L3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Csmd1Q923L3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Csmd1Q923L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
Csmd1Q923L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Csmd1Q923L3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Csmd1Q923L3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Csmd1Q923L3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Csmd1Q923L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Csmd1Q923L3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Csmd1Q923L3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Csmd1Q923L3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Csmd1Q923L3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Csmd1Q923L3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Csmd1Q923L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Csmd1Q923L3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Csmd1Q923L3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Csmd1Q923L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Csmd1Q923L3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Csmd1Q923L3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Csmd1Q923L3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Csmd1Q923L3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Csmd1Q923L3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Csmd1Q923L3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms