Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab4bQ91ZR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab4bQ91ZR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab4bQ91ZR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab4bQ91ZR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab4bQ91ZR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab4bQ91ZR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab4bQ91ZR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab4bQ91ZR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab4bQ91ZR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab4bQ91ZR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms