Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde6cQ91ZQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde6cQ91ZQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde6cQ91ZQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde6cQ91ZQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde6cQ91ZQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pde6cQ91ZQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde6cQ91ZQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde6cQ91ZQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde6cQ91ZQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pde6cQ91ZQ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pde6cQ91ZQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde6cQ91ZQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde6cQ91ZQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde6cQ91ZQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde6cQ91ZQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde6cQ91ZQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde6cQ91ZQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde6cQ91ZQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde6cQ91ZQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde6cQ91ZQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde6cQ91ZQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde6cQ91ZQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde6cQ91ZQ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde6cQ91ZQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde6cQ91ZQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pde6cQ91ZQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pde6cQ91ZQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde6cQ91ZQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
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