Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Odf4Q8VI88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Odf4Q8VI88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Odf4Q8VI88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf4Q8VI88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Odf4Q8VI88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf4Q8VI88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odf4Q8VI88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf4Q8VI88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf4Q8VI88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf4Q8VI88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf4Q8VI88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf4Q8VI88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf4Q8VI88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf4Q8VI88 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf4Q8VI88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf4Q8VI88 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf4Q8VI88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odf4Q8VI88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Odf4Q8VI88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Odf4Q8VI88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Odf4Q8VI88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Odf4Q8VI88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Odf4Q8VI88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms