Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rhbdd2Q8VEK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhbdd2Q8VEK2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhbdd2Q8VEK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhbdd2Q8VEK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdd2Q8VEK2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdd2Q8VEK2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhbdd2Q8VEK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdd2Q8VEK2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhbdd2Q8VEK2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhbdd2Q8VEK2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhbdd2Q8VEK2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhbdd2Q8VEK2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdd2Q8VEK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdd2Q8VEK2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdd2Q8VEK2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms