Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDW4

Ube2w, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2wQ8VDW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17,84■□□□□ 0,45
Ube2wQ8VDW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17,77■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Ube2wQ8VDW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Ube2wQ8VDW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17,67■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Ube2wQ8VDW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17,6■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,59■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,59■□□□□ 0,41
Ube2wQ8VDW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17,55■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Ube2wQ8VDW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17,5■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Ube2wQ8VDW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17,42■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Ube2wQ8VDW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,38■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17,37■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17,37■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Ube2wQ8VDW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms