Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC12

Uroc1, Urocanate hydratase, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uroc1Q8VC12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Uroc1Q8VC12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Uroc1Q8VC12 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uroc1Q8VC12 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uroc1Q8VC12 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Uroc1Q8VC12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Uroc1Q8VC12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Uroc1Q8VC12 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uroc1Q8VC12 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Uroc1Q8VC12 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uroc1Q8VC12 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uroc1Q8VC12 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Uroc1Q8VC12 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uroc1Q8VC12 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uroc1Q8VC12 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uroc1Q8VC12 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Uroc1Q8VC12 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uroc1Q8VC12 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uroc1Q8VC12 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uroc1Q8VC12 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Uroc1Q8VC12 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uroc1Q8VC12 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uroc1Q8VC12 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uroc1Q8VC12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uroc1Q8VC12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Uroc1Q8VC12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uroc1Q8VC12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uroc1Q8VC12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms