Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc80Q8R2G6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc80Q8R2G6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc80Q8R2G6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc80Q8R2G6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc80Q8R2G6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc80Q8R2G6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc80Q8R2G6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc80Q8R2G6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc80Q8R2G6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc80Q8R2G6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc80Q8R2G6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc80Q8R2G6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc80Q8R2G6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc80Q8R2G6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc80Q8R2G6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc80Q8R2G6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc80Q8R2G6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc80Q8R2G6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc80Q8R2G6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms