Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Acvr1cQ8K348 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Acvr1cQ8K348 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Acvr1cQ8K348 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Acvr1cQ8K348 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Acvr1cQ8K348 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Acvr1cQ8K348 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Acvr1cQ8K348 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Acvr1cQ8K348 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Acvr1cQ8K348 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Acvr1cQ8K348 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Acvr1cQ8K348 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Acvr1cQ8K348 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Acvr1cQ8K348 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Acvr1cQ8K348 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Acvr1cQ8K348 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Acvr1cQ8K348 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Acvr1cQ8K348 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Acvr1cQ8K348 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Acvr1cQ8K348 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Acvr1cQ8K348 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Acvr1cQ8K348 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Acvr1cQ8K348 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Acvr1cQ8K348 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Acvr1cQ8K348 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Acvr1cQ8K348 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Acvr1cQ8K348 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Acvr1cQ8K348 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Acvr1cQ8K348 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Acvr1cQ8K348 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Acvr1cQ8K348 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms