Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plac9Q8K262 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Plac9Q8K262 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Plac9Q8K262 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plac9Q8K262 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Plac9Q8K262 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plac9Q8K262 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plac9Q8K262 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plac9Q8K262 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plac9Q8K262 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plac9Q8K262 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms