Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nupl2Q8CIC2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nupl2Q8CIC2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nupl2Q8CIC2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nupl2Q8CIC2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nupl2Q8CIC2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nupl2Q8CIC2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nupl2Q8CIC2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nupl2Q8CIC2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nupl2Q8CIC2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nupl2Q8CIC2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nupl2Q8CIC2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nupl2Q8CIC2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nupl2Q8CIC2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nupl2Q8CIC2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.7 ms