Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csnka2ipQ8CH19 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csnka2ipQ8CH19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csnka2ipQ8CH19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csnka2ipQ8CH19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Csnka2ipQ8CH19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csnka2ipQ8CH19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csnka2ipQ8CH19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csnka2ipQ8CH19 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Csnka2ipQ8CH19 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Csnka2ipQ8CH19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Csnka2ipQ8CH19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Csnka2ipQ8CH19 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Csnka2ipQ8CH19 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csnka2ipQ8CH19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csnka2ipQ8CH19 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csnka2ipQ8CH19 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csnka2ipQ8CH19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csnka2ipQ8CH19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csnka2ipQ8CH19 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csnka2ipQ8CH19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csnka2ipQ8CH19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csnka2ipQ8CH19 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csnka2ipQ8CH19 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csnka2ipQ8CH19 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csnka2ipQ8CH19 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Csnka2ipQ8CH19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Csnka2ipQ8CH19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csnka2ipQ8CH19 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms