Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gpc3Q8CFZ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpc3Q8CFZ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpc3Q8CFZ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gpc3Q8CFZ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpc3Q8CFZ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpc3Q8CFZ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpc3Q8CFZ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpc3Q8CFZ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpc3Q8CFZ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpc3Q8CFZ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpc3Q8CFZ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpc3Q8CFZ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpc3Q8CFZ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gpc3Q8CFZ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpc3Q8CFZ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpc3Q8CFZ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpc3Q8CFZ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpc3Q8CFZ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpc3Q8CFZ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpc3Q8CFZ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gpc3Q8CFZ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpc3Q8CFZ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpc3Q8CFZ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc3Q8CFZ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc3Q8CFZ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpc3Q8CFZ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms