Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klf17Q8CFA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klf17Q8CFA7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klf17Q8CFA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klf17Q8CFA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klf17Q8CFA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf17Q8CFA7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf17Q8CFA7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf17Q8CFA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf17Q8CFA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf17Q8CFA7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf17Q8CFA7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf17Q8CFA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf17Q8CFA7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf17Q8CFA7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf17Q8CFA7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf17Q8CFA7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf17Q8CFA7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf17Q8CFA7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf17Q8CFA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf17Q8CFA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf17Q8CFA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf17Q8CFA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf17Q8CFA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms