Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp27Q8CEG8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp27Q8CEG8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp27Q8CEG8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp27Q8CEG8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp27Q8CEG8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp27Q8CEG8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp27Q8CEG8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp27Q8CEG8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp27Q8CEG8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp27Q8CEG8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp27Q8CEG8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp27Q8CEG8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp27Q8CEG8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp27Q8CEG8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp27Q8CEG8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp27Q8CEG8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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