Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Chic1Q8CBW7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Chic1Q8CBW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Chic1Q8CBW7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Chic1Q8CBW7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Chic1Q8CBW7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Chic1Q8CBW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Chic1Q8CBW7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Chic1Q8CBW7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Chic1Q8CBW7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Chic1Q8CBW7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
Chic1Q8CBW7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Chic1Q8CBW7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Chic1Q8CBW7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Chic1Q8CBW7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Chic1Q8CBW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Chic1Q8CBW7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Chic1Q8CBW7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Chic1Q8CBW7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Chic1Q8CBW7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Chic1Q8CBW7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Chic1Q8CBW7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Chic1Q8CBW7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Chic1Q8CBW7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Chic1Q8CBW7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Chic1Q8CBW7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Chic1Q8CBW7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
Chic1Q8CBW7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Chic1Q8CBW7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Chic1Q8CBW7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Chic1Q8CBW7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Chic1Q8CBW7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Chic1Q8CBW7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Chic1Q8CBW7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Chic1Q8CBW7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Chic1Q8CBW7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
Chic1Q8CBW7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Chic1Q8CBW7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
Chic1Q8CBW7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Chic1Q8CBW7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Chic1Q8CBW7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Chic1Q8CBW7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Chic1Q8CBW7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Chic1Q8CBW7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Chic1Q8CBW7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Chic1Q8CBW7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
Chic1Q8CBW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Chic1Q8CBW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Chic1Q8CBW7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Chic1Q8CBW7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Chic1Q8CBW7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Chic1Q8CBW7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
Chic1Q8CBW7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Chic1Q8CBW7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Chic1Q8CBW7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Chic1Q8CBW7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Chic1Q8CBW7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Chic1Q8CBW7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Chic1Q8CBW7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Chic1Q8CBW7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Chic1Q8CBW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Chic1Q8CBW7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Chic1Q8CBW7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Chic1Q8CBW7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Chic1Q8CBW7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Chic1Q8CBW7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
Chic1Q8CBW7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Chic1Q8CBW7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Chic1Q8CBW7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
Chic1Q8CBW7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Chic1Q8CBW7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Chic1Q8CBW7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Chic1Q8CBW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Chic1Q8CBW7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Chic1Q8CBW7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms