Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gpc5Q8CAL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gpc5Q8CAL5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gpc5Q8CAL5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gpc5Q8CAL5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpc5Q8CAL5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gpc5Q8CAL5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpc5Q8CAL5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gpc5Q8CAL5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpc5Q8CAL5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gpc5Q8CAL5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpc5Q8CAL5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpc5Q8CAL5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpc5Q8CAL5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpc5Q8CAL5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpc5Q8CAL5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpc5Q8CAL5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gpc5Q8CAL5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpc5Q8CAL5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpc5Q8CAL5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpc5Q8CAL5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpc5Q8CAL5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpc5Q8CAL5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpc5Q8CAL5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gpc5Q8CAL5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gpc5Q8CAL5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gpc5Q8CAL5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc5Q8CAL5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc5Q8CAL5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpc5Q8CAL5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpc5Q8CAL5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpc5Q8CAL5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpc5Q8CAL5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc5Q8CAL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpc5Q8CAL5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms