Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdcl3Q8BVF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdcl3Q8BVF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcl3Q8BVF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdcl3Q8BVF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcl3Q8BVF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdcl3Q8BVF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pdcl3Q8BVF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdcl3Q8BVF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pdcl3Q8BVF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdcl3Q8BVF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdcl3Q8BVF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcl3Q8BVF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcl3Q8BVF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcl3Q8BVF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcl3Q8BVF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcl3Q8BVF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcl3Q8BVF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcl3Q8BVF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcl3Q8BVF2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms