Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec9aQ8BRU4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec9aQ8BRU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec9aQ8BRU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec9aQ8BRU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec9aQ8BRU4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec9aQ8BRU4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec9aQ8BRU4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec9aQ8BRU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec9aQ8BRU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec9aQ8BRU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec9aQ8BRU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec9aQ8BRU4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec9aQ8BRU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec9aQ8BRU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec9aQ8BRU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec9aQ8BRU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec9aQ8BRU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms