Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
AtripQ8BMG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
AtripQ8BMG1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
AtripQ8BMG1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
AtripQ8BMG1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
AtripQ8BMG1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
AtripQ8BMG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
AtripQ8BMG1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
AtripQ8BMG1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
AtripQ8BMG1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
AtripQ8BMG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
AtripQ8BMG1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
AtripQ8BMG1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
AtripQ8BMG1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
AtripQ8BMG1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
AtripQ8BMG1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
AtripQ8BMG1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
AtripQ8BMG1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
AtripQ8BMG1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
AtripQ8BMG1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
AtripQ8BMG1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
AtripQ8BMG1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
AtripQ8BMG1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms