Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GopcQ8BH60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GopcQ8BH60 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GopcQ8BH60 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GopcQ8BH60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GopcQ8BH60 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GopcQ8BH60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GopcQ8BH60 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GopcQ8BH60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GopcQ8BH60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GopcQ8BH60 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GopcQ8BH60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GopcQ8BH60 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GopcQ8BH60 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GopcQ8BH60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GopcQ8BH60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GopcQ8BH60 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GopcQ8BH60 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GopcQ8BH60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GopcQ8BH60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GopcQ8BH60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GopcQ8BH60 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GopcQ8BH60 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GopcQ8BH60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GopcQ8BH60 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GopcQ8BH60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GopcQ8BH60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GopcQ8BH60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GopcQ8BH60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GopcQ8BH60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GopcQ8BH60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GopcQ8BH60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GopcQ8BH60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GopcQ8BH60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GopcQ8BH60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GopcQ8BH60 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GopcQ8BH60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GopcQ8BH60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GopcQ8BH60 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GopcQ8BH60 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GopcQ8BH60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GopcQ8BH60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GopcQ8BH60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms