Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Cct8l1Q80YT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cct8l1Q80YT3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Cct8l1Q80YT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cct8l1Q80YT3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cct8l1Q80YT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cct8l1Q80YT3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cct8l1Q80YT3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Cct8l1Q80YT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cct8l1Q80YT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cct8l1Q80YT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cct8l1Q80YT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Cct8l1Q80YT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cct8l1Q80YT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cct8l1Q80YT3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Cct8l1Q80YT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Cct8l1Q80YT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Cct8l1Q80YT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Cct8l1Q80YT3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cct8l1Q80YT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Cct8l1Q80YT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,8 ms