Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q80UB0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q80UB0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q80UB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q80UB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q80UB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q80UB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q80UB0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q80UB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q80UB0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q80UB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q80UB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q80UB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q80UB0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80UB0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q80UB0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q80UB0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q80UB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q80UB0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q80UB0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q80UB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q80UB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q80UB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q80UB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q80UB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q80UB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q80UB0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q80UB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q80UB0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q80UB0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80UB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80UB0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80UB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80UB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80UB0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80UB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80UB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q80UB0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80UB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q80UB0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q80UB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q80UB0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q80UB0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80UB0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80UB0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80UB0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80UB0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80UB0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q80UB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q80UB0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80UB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80UB0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80UB0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80UB0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80UB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80UB0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Q80UB0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80UB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q80UB0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80UB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80UB0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80UB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80UB0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80UB0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80UB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80UB0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80UB0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80UB0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80UB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80UB0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80UB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q80UB0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q80UB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q80UB0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q80UB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q80UB0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q80UB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q80UB0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q80UB0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q80UB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q80UB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q80UB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q80UB0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q80UB0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q80UB0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q80UB0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q80UB0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q80UB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q80UB0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q80UB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q80UB0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q80UB0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q80UB0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q80UB0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q80UB0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q80UB0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q80UB0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q80UB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q80UB0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q80UB0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms