Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup214Q80U93 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup214Q80U93 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup214Q80U93 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup214Q80U93 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup214Q80U93 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup214Q80U93 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup214Q80U93 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup214Q80U93 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup214Q80U93 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nup214Q80U93 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup214Q80U93 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup214Q80U93 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nup214Q80U93 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup214Q80U93 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup214Q80U93 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup214Q80U93 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup214Q80U93 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup214Q80U93 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup214Q80U93 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup214Q80U93 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup214Q80U93 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup214Q80U93 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup214Q80U93 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms