Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmc8Q7TN58 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmc8Q7TN58 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmc8Q7TN58 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmc8Q7TN58 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmc8Q7TN58 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmc8Q7TN58 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmc8Q7TN58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tmc8Q7TN58 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmc8Q7TN58 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmc8Q7TN58 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmc8Q7TN58 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmc8Q7TN58 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmc8Q7TN58 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmc8Q7TN58 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmc8Q7TN58 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmc8Q7TN58 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmc8Q7TN58 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmc8Q7TN58 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmc8Q7TN58 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmc8Q7TN58 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmc8Q7TN58 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmc8Q7TN58 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmc8Q7TN58 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmc8Q7TN58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmc8Q7TN58 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmc8Q7TN58 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmc8Q7TN58 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmc8Q7TN58 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmc8Q7TN58 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmc8Q7TN58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms