Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SyncripQ7TMK9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SyncripQ7TMK9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SyncripQ7TMK9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SyncripQ7TMK9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SyncripQ7TMK9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SyncripQ7TMK9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SyncripQ7TMK9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SyncripQ7TMK9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SyncripQ7TMK9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SyncripQ7TMK9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SyncripQ7TMK9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SyncripQ7TMK9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SyncripQ7TMK9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SyncripQ7TMK9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SyncripQ7TMK9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SyncripQ7TMK9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SyncripQ7TMK9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SyncripQ7TMK9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SyncripQ7TMK9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SyncripQ7TMK9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SyncripQ7TMK9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SyncripQ7TMK9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SyncripQ7TMK9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SyncripQ7TMK9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SyncripQ7TMK9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SyncripQ7TMK9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SyncripQ7TMK9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms