Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GfralQ6SJE0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GfralQ6SJE0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GfralQ6SJE0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GfralQ6SJE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GfralQ6SJE0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GfralQ6SJE0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GfralQ6SJE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GfralQ6SJE0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GfralQ6SJE0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GfralQ6SJE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GfralQ6SJE0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GfralQ6SJE0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GfralQ6SJE0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GfralQ6SJE0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GfralQ6SJE0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GfralQ6SJE0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GfralQ6SJE0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms