Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Papd7Q6PB75 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Papd7Q6PB75 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Papd7Q6PB75 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Papd7Q6PB75 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Papd7Q6PB75 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Papd7Q6PB75 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Papd7Q6PB75 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Papd7Q6PB75 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Papd7Q6PB75 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Papd7Q6PB75 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Papd7Q6PB75 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Papd7Q6PB75 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Papd7Q6PB75 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Papd7Q6PB75 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Papd7Q6PB75 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Papd7Q6PB75 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms