Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga2Q6P5E6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gga2Q6P5E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga2Q6P5E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga2Q6P5E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gga2Q6P5E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga2Q6P5E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gga2Q6P5E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gga2Q6P5E6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga2Q6P5E6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga2Q6P5E6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga2Q6P5E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga2Q6P5E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gga2Q6P5E6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga2Q6P5E6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga2Q6P5E6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gga2Q6P5E6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga2Q6P5E6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga2Q6P5E6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gga2Q6P5E6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gga2Q6P5E6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga2Q6P5E6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gga2Q6P5E6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gga2Q6P5E6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gga2Q6P5E6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gga2Q6P5E6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms