Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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