Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn11Q6J756 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn11Q6J756 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn11Q6J756 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn11Q6J756 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn11Q6J756 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn11Q6J756 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn11Q6J756 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn11Q6J756 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn11Q6J756 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn11Q6J756 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn11Q6J756 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capn11Q6J756 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn11Q6J756 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capn11Q6J756 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms