Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Otud6aQ6IE21 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Otud6aQ6IE21 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otud6aQ6IE21 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6aQ6IE21 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6aQ6IE21 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Otud6aQ6IE21 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud6aQ6IE21 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6aQ6IE21 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud6aQ6IE21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud6aQ6IE21 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud6aQ6IE21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6aQ6IE21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms