Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Gja3Q64448 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Gja3Q64448 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Gja3Q64448 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Gja3Q64448 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Gja3Q64448 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Gja3Q64448 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Gja3Q64448 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Gja3Q64448 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Gja3Q64448 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Gja3Q64448 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Gja3Q64448 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Gja3Q64448 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,05■■■□□ 2,72
Gja3Q64448 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Gja3Q64448 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Gja3Q64448 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Gja3Q64448 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Gja3Q64448 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Gja3Q64448 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Gja3Q64448 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Gja3Q64448 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Gja3Q64448 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Gja3Q64448 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31,86■■■□□ 2,69
Gja3Q64448 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Gja3Q64448 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Gja3Q64448 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Gja3Q64448 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Gja3Q64448 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Gja3Q64448 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Gja3Q64448 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Gja3Q64448 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gja3Q64448 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gja3Q64448 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Gja3Q64448 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Gja3Q64448 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Gja3Q64448 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Gja3Q64448 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gja3Q64448 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Gja3Q64448 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gja3Q64448 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Gja3Q64448 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Gja3Q64448 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Gja3Q64448 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Gja3Q64448 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Gja3Q64448 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Gja3Q64448 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Gja3Q64448 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Gja3Q64448 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Gja3Q64448 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Gja3Q64448 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Gja3Q64448 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Gja3Q64448 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gja3Q64448 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Gja3Q64448 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Gja3Q64448 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31,02■■■□□ 2,56
Gja3Q64448 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Gja3Q64448 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Gja3Q64448 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Gja3Q64448 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Gja3Q64448 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Gja3Q64448 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,94■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gja3Q64448 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Gja3Q64448 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,4 ms