Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nr2e1Q64104 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr2e1Q64104 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nr2e1Q64104 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nr2e1Q64104 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nr2e1Q64104 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nr2e1Q64104 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nr2e1Q64104 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nr2e1Q64104 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr2e1Q64104 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr2e1Q64104 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr2e1Q64104 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nr2e1Q64104 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nr2e1Q64104 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr2e1Q64104 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nr2e1Q64104 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nr2e1Q64104 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nr2e1Q64104 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nr2e1Q64104 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nr2e1Q64104 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr2e1Q64104 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nr2e1Q64104 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nr2e1Q64104 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nr2e1Q64104 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nr2e1Q64104 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nr2e1Q64104 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nr2e1Q64104 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nr2e1Q64104 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nr2e1Q64104 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nr2e1Q64104 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nr2e1Q64104 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nr2e1Q64104 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nr2e1Q64104 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nr2e1Q64104 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr2e1Q64104 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Nr2e1Q64104 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms