Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnc3Q63959 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnc3Q63959 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnc3Q63959 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnc3Q63959 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnc3Q63959 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnc3Q63959 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnc3Q63959 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnc3Q63959 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnc3Q63959 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnc3Q63959 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnc3Q63959 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnc3Q63959 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnc3Q63959 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnc3Q63959 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnc3Q63959 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnc3Q63959 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnc3Q63959 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnc3Q63959 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnc3Q63959 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnc3Q63959 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnc3Q63959 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnc3Q63959 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnc3Q63959 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnc3Q63959 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnc3Q63959 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnc3Q63959 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnc3Q63959 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms