Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spock1Q62288 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spock1Q62288 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spock1Q62288 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spock1Q62288 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spock1Q62288 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spock1Q62288 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spock1Q62288 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock1Q62288 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock1Q62288 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spock1Q62288 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock1Q62288 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock1Q62288 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spock1Q62288 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spock1Q62288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spock1Q62288 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spock1Q62288 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spock1Q62288 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spock1Q62288 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms