Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SypQ62277 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SypQ62277 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SypQ62277 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SypQ62277 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SypQ62277 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SypQ62277 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SypQ62277 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SypQ62277 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SypQ62277 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SypQ62277 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SypQ62277 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SypQ62277 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SypQ62277 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SypQ62277 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SypQ62277 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SypQ62277 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SypQ62277 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SypQ62277 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SypQ62277 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SypQ62277 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SypQ62277 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SypQ62277 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SypQ62277 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SypQ62277 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SypQ62277 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SypQ62277 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SypQ62277 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SypQ62277 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SypQ62277 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SypQ62277 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SypQ62277 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SypQ62277 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SypQ62277 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SypQ62277 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SypQ62277 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SypQ62277 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SypQ62277 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SypQ62277 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SypQ62277 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SypQ62277 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SypQ62277 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SypQ62277 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SypQ62277 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SypQ62277 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SypQ62277 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SypQ62277 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SypQ62277 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SypQ62277 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SypQ62277 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SypQ62277 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SypQ62277 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SypQ62277 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SypQ62277 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SypQ62277 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SypQ62277 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SypQ62277 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SypQ62277 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SypQ62277 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SypQ62277 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SypQ62277 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SypQ62277 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SypQ62277 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SypQ62277 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SypQ62277 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SypQ62277 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SypQ62277 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SypQ62277 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SypQ62277 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SypQ62277 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SypQ62277 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SypQ62277 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SypQ62277 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SypQ62277 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SypQ62277 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SypQ62277 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SypQ62277 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SypQ62277 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SypQ62277 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SypQ62277 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SypQ62277 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SypQ62277 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SypQ62277 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SypQ62277 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SypQ62277 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SypQ62277 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SypQ62277 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SypQ62277 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SypQ62277 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SypQ62277 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SypQ62277 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SypQ62277 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SypQ62277 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SypQ62277 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SypQ62277 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SypQ62277 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SypQ62277 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SypQ62277 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SypQ62277 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SypQ62277 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms