Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IbspQ61711 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IbspQ61711 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IbspQ61711 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IbspQ61711 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IbspQ61711 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IbspQ61711 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IbspQ61711 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IbspQ61711 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IbspQ61711 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IbspQ61711 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IbspQ61711 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IbspQ61711 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IbspQ61711 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IbspQ61711 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IbspQ61711 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IbspQ61711 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IbspQ61711 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IbspQ61711 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IbspQ61711 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IbspQ61711 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IbspQ61711 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IbspQ61711 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IbspQ61711 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IbspQ61711 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IbspQ61711 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IbspQ61711 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IbspQ61711 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IbspQ61711 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IbspQ61711 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IbspQ61711 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IbspQ61711 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IbspQ61711 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IbspQ61711 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms